重要なお知らせ（開発中／非製品／個人制作）
- 本ページで紹介する「Complexlab」は開発中の個人プロジェクトであり、製品版ではありません。
- 機能・仕様は予告なく変更／停止される場合があります。研究・教育目的での試用を想定し、いかなる保証も提供しません。
- ご利用は自己責任でお願いします。
外部ソフトのライセンスについて（ORCA など）
本アプリは ORCA 等の量子化学プログラムを同梱しません。UI からローカルの外部プログラムを起動する設計です。説明は個人の趣味・学習の範囲を前提に記載しています。商用・業務利用は各ソフトのライセンス条件を必ず確認し、必要に応じて別途契約をご手配ください。
例：距離ラベル表示と注釈（開発中 UI）。計算結果の取り込み・可視化も行えます。
できること（概要）
- 表示：XYZ/MOL/SDF の読み込み、回転・ズーム、スタイル切替
- 測定：距離・角度・二面角のワンクリック計測、ラベル付与
- 出力：注釈画像（PNG/JPG）、測定値 CSV
- 量子化学計算（UIから）：外部プログラム（例：ORCA）を UI から実行（開発中）。最適化（OPT）／周波数（FREQ）／単点（SP）の実行と、結果の取り込み・表示。
量子化学計算（UI実行）のイメージ
- 入力作成：読み込んだ構造に対し、理論レベル・基底関数・分散補正などのテンプレを UI で選択（例：DFT B3LYP/def2-SVP, D3(BJ)）。
- ジョブ投入：ボタン一つでプロジェクト内の
jobs/ に入力ファイルを生成し、外部プログラムを起動。
- 進捗表示：ログの末尾を追跡して簡易ステータスを表示（実装中）。
- 結果取り込み：エネルギー、最適化座標、HOMO-LUMO 近似、Mulliken/CM5 電荷、双極子、IR 予測（FREQ）などを読み込み、表と図に整形。
- 可視化：最終構造の注釈画像、IR 予測ピークのスペクトル出力。必要に応じて Analysiscopilot に渡して実測とオーバーレイ。
※ 上記は開発中の設計方針を含みます。実装済み範囲はバージョンにより異なります。
3分クイックスタート（最適化 + 周波数）
- 設定：設定 → 計算 で外部実行パスを指定（例：
/usr/local/bin/orca）。未設定時は計算機能は無効のまま。
- 構造：H2O や CH4 の XYZ を読み込み。
- ジョブ：DFT: B3LYP/def2-SVP、OPT + FREQ を選択 → Run。
- 結果：最終エネルギーと IR 予測を確認 → 画像/CSV を出力。
安全のため、未設定時は計算ボタンを非活性化し、実行先はプロジェクト配下の jobs/ に限定します（外部送信なし）。
対応形式・動作環境
- 入出力：XYZ／MOL／SDF、PNG/JPG、CSV（測定値・計算結果要約）
- OS：Windows / macOS（ローカル実行、PySide6 ベース）
セキュリティ／プライバシー
- 研究データは端末内で処理。ネットワーク接続なしでも動作可能。
- 計算はローカルの外部プログラムを起動。クラウド送信は行いません。
使い方（可視化の基本）
- アプリを起動し、XYZ/MOL/SDF を読み込み
- 距離ラベルや配位表示で相互作用を確認
- 画像や CSV を出力して、研究ノートやスライドに貼り付け